新聞中(zhōng)心
來源:以下(xià)文章來源于Cytiva思拓凡 ,作者Li Yafei
2023年2月25日,中(zhōng)華中(zhōng)醫藥學會發布了2022年中(zhōng)醫藥十大(dà)學術進展。張伯禮院士指出:2022年度中(zhōng)醫藥十大(dà)學術進展主要呈現的價值,就包括“重視新技術新方法在中(zhōng)醫藥中(zhōng)的應用”。北(běi)京大(dà)學醫學部曾克武教授和屠鵬飛教授與浙江大(dà)學、大(dà)連醫科大(dà)學、博奧生(shēng)物(wù)研究團隊憑借“新技術助力中(zhōng)藥功效科學内涵闡釋”共同獲選2022年度中(zhōng)醫藥十大(dà)學術進展。
中(zhōng)醫藥研究者中(zhōng)有廣泛的Biacore用戶基礎,曾克武教授和屠鵬飛教授團隊的這一(yī)成果裏自然也有Biacore的身影。接下(xià)來就讓小(xiǎo)編帶您領略Biacore這一(yī)現代科技,如何與傳統中(zhōng)醫藥碰撞并融合,從而闡釋中(zhōng)藥功效科學的内涵。
天然産物(wù)中(zhōng)抗腫瘤活性分(fēn)子
發現及作用機制揭示1
腫瘤免疫微環境(Tumor immune microenvironment ,TIME)調控因子IGF2BP1是一(yī)種關鍵N6 -甲基腺苷 (m6A) 閱讀蛋白(bái),識别m6A靶點轉錄物(wù),被認爲是腫瘤治療的潛在靶點。2022年曾克武教授和屠鵬飛教授團隊發表的研究成果中(zhōng),發現了天然産物(wù)葫蘆素B通過結合IGF2BP1發揮抗腫瘤作用,并且闡釋了作用機制。
以IGF2BP1爲出發點,作者首先發現,在小(xiǎo)鼠H22荷瘤模型中(zhōng)敲低IGF2BP1,可以通過免疫細胞招募和降低TIME中(zhōng)PD-L1的表達來抑制肝細胞癌的進展。使用Biacore 8K,作者驗證了IGF2BP1與甲基化單鏈RNA(ss-m6A)的強親和力,達到了18.3 nM。并且發現,IGF2BP1與非甲基化RNA(ss-A)的親和力則低了13倍。
确定了治療靶點之後,作者使用Biacore 8K,直接從包含889種化合物(wù)的中(zhōng)藥天然産物(wù)庫中(zhōng)篩選能抑制IGF2BP1與其m6A靶點的活性分(fēn)子。通過合成生(shēng)物(wù)素标記的ss-m6A,作者将RNA直接固定在芯片上,将化合物(wù)固定濃度(20 μM)與IGF2BP1預孵育,檢測RNA與化合物(wù)- IGF2BP1的結合信号,從而直接篩選出具有抑制效果的天然産物(wù)(圖1)。
圖1:Biacore 8K抑制劑篩選方法示意圖
通過Biacore 8K的高通量抑制劑篩選實驗,作者得到了抑制劑篩選的排序。從圖2中(zhōng)可以直觀看出,六種具有較強抑制效果的天然産物(wù)被發現,其中(zhōng)抑制效果最強的當屬葫蘆素B(CuB)。在Huh增殖抑制實驗中(zhōng),葫蘆素B同樣表現出了抑制作用,72h時的IC50達到1.0 uM。
圖2:Biacore 8K抑制劑篩選結果
高通量篩選+精确表征,在藥物(wù)研究的各個階段都少不了Biacore。在篩選得到葫蘆素B後,作者當然同樣使用Biacore精确表征了IGF2BP1與葫蘆素B的親和力。結果發現,二者的親和力達到了1.2 μM,與細胞實驗相互印證(圖3)。
圖3:Biacore精确表征IGF2BP1與CuB的親和力
葫蘆素B又(yòu)是什麽呢?
葫蘆素B是從葫蘆科等植物(wù)中(zhōng)分(fēn)離(lí)得到的一(yī)類四環三萜類化合物(wù),具有廣泛的藥理活性。以葫蘆素B爲主要成分(fēn)的葫蘆素制劑在臨床治療濕熱毒盛所緻的遷延性肝炎、肝硬化和原發性肝癌具有确切療效。中(zhōng)藥研究,除了根據已知(zhī)靶點從天然産物(wù)庫中(zhōng)找活性分(fēn)子外(wài),另一(yī)個角度則是已知(zhī)活性分(fēn)子,尋找作用靶點。在通過抑制劑篩選及表征,從靶點IGF2BP1出發找到活性分(fēn)子葫蘆素B後,作者使用“鈎釣”的方法,驗證是否能利用葫蘆素B“鈎”出靶點IGF2BP1。
作者首先合成了葫蘆素B分(fēn)子探針,然後利用pull-down + 質譜的方法從Huh細胞裂解液中(zhōng)成功“鈎”到了靶點IGF2BP1,并且在免疫熒光共定位實驗中(zhōng)證明了細胞中(zhōng)葫蘆素B與IGF2BP1的結合。至此,不論是從靶點出發找活性分(fēn)子,還是從活性分(fēn)子出發找靶點,雙管齊下(xià),作者明确了葫蘆素B與腫瘤免疫微環境調控因子IGF2BP1的直接結合。
爲了進一(yī)步闡釋葫蘆素B的抗腫瘤機制,作者研究了IGF2BP1上葫蘆素B的結合位置及結合方式。将IGF2BP1的結構域逐一(yī)删除後,作者發現隻有缺失了C端KH結構域會使IGF2BP1與葫蘆素B不能結合。通過質譜、pull-down、BLAST、CD等多種方法,作者最終确定,葫蘆素B通過邁克爾加成反應結合在IGF2BP1中(zhōng)KH1−2結構域的Cys253上,并且會引起IGF2BP1的構象變化。
那麽葫蘆素B又(yòu)是如何影響IGF2BP1的功能呢?
IGF2BP1本身會與ss-m6A結合,前面作者使用Biacore做了二者抑制劑的高通量篩選,得到了葫蘆素B。高通量抑制劑篩選能做,單獨的抑制劑表征當然手到擒來。作者設置了Biacore實驗來從生(shēng)化角度上表征葫蘆素B的抑制效果。從結果可以看出,随着葫蘆素B的濃度逐漸提高,IGF2BP1與ss-m6A的結合信号越來越低(圖4)。Biacore結果與RNA pull-down實驗一(yī)緻,明确了葫蘆素B可以抑制二者結合。
圖4:Biacore實驗明确葫蘆素B抑制IGF2BP1與ss m6A的結合
後續作者還發現,葫蘆素B可以降低與IGF2BP1所結合的mRNA(包括c-MYC、KRAS 等mRNAs)穩定性,在體(tǐ)内通過誘導細胞凋亡,招募免疫細胞到腫瘤微環境,阻斷PD-L1的表達,最終表現出明顯的抗腫瘤效果(圖5)。
圖5:文章主要研究路線及作用機制概述
曾克武教授和屠鵬飛教授團隊專注于天然活性分(fēn)子治療各類型重大(dà)疾病的發現及機制闡釋,開(kāi)發了包括分(fēn)子探針、蛋白(bái)芯片2在内的多種靶點“鈎釣”技術,多年以來,許多研究成果中(zhōng)均使用了Biacore作爲生(shēng)物(wù)分(fēn)子相互作用檢測技術。中(zhōng)國科學院院士陳凱先教授指出:年度的學術進展是中(zhōng)醫藥學術研究的“指南(nán)針”和“風向标”。相信此次研究成果的入選,也将爲廣大(dà)中(zhōng)醫藥研究者提供更多研究思路,對“積極推進中(zhōng)醫藥科研和創新,推動傳統中(zhōng)醫藥和現代科學結合”有重要意義。
Biacore
作爲現代化的體(tǐ)外(wài)分(fēn)子互作“金标準”,以其超高的靈敏度,超高的數據質量,無分(fēn)子量檢測下(xià)限,适用于各類型的天然産物(wù)及生(shēng)物(wù)分(fēn)子研究,在中(zhōng)醫藥研究者中(zhōng)有廣泛的用戶基礎。Biacore将持續與廣大(dà)中(zhōng)醫藥研究者勠力同心,共同推動中(zhōng)醫藥的現代化研究和應用。
Biacore,for a better life
參考文獻:
[1] Liu Y , Guo Q , Yang H , et al. Allosteric Regulation of IGF2BP1 as a Novel Strategy for the Activation of Tumor Immune Microenvironment[J]. 2022.
[2] Zhang et al. Neuroinflammation inhibition by small-molecule targeting USP7 noncatalytic domain for neurodegenerative disease therapy, Sci. Adv. 8, eabo0789 (2022)