新聞中(zhōng)心
近日,中(zhōng)國農業科學院哈爾濱獸醫研究所王曉鈞團隊在《PLoS Pathogens》雜(zá)志(zhì)刊載了題爲 「Selective usage of ANP32 proteins by influenza B virus polymerase: Implications in determination of host range」的文章。該文章系統性地揭示了 B 型流感病毒感染的種間限制機制,發現宿主 ANP32A&B 蛋白(bái)是決定 B 型流感病毒聚合酶活性的須關鍵因子。
甲型流感病毒(IAV)和乙型流感病毒(IBV)屬于正粘病毒科。禽類作爲 IAV 的重要宿主,經常将 IAV 跨物(wù)種傳播給哺乳動物(wù)。而 IBV 與 IAV 複制機制類似且受體(tǐ)相同,卻少有禽類自然感染 IBV 的報道,這說明 IBV 在禽類體(tǐ)内無法複制,但具體(tǐ)機制尚不明确。
圖 2 乙型流感病毒結構示意圖
前期研究已經證明,宿主 ANP32A&B 蛋白(bái)在 IAV 聚合酶活性中(zhōng)起到關鍵性作用,那麽 ANP32 蛋白(bái)是否在 IBV 的複制中(zhōng)也具有類似的功能呢?不同物(wù)種的 ANP32 蛋白(bái)是否爲 IBV 提供不同的支持?
研究團隊構建出不同的細胞系,利用聚合酶雙熒光報告系統等技術,獲得重大(dà)發現,其中(zhōng)兩點尤爲突出:
1.ANP32A、ANP32B 對于 IBV 的複制起主要作用,ANP32E 的作用相對有限;
2.哺乳動物(wù) ANP32A&B 蛋白(bái)可以完全支持 IBV 聚合酶複制,而禽類 ANP32A 由于有 33 個氨基酸的插入以及禽類 ANP32B 由于 129/130 位點的突變,導緻禽類 ANP32A&B 均無法支持 IBV 的複制。
爲進一(yī)步探索不同物(wù)種 ANP32 蛋白(bái)支持 IBV 聚合酶活性差異的分(fēn)子機制,該研究利用 Co-IP,以及基于 Biacore 的表面等離(lí)子共振 SPR 等技術進行相關檢測。
Co-IP 實驗結果顯示: huANP32A 和 chANP32A 對于 IBV 聚合酶具有相似的結合能力,但無法給出定量的結合差異分(fēn)析。爲了解決這個問題,研究人員(yuán)使用 Biacore 對 IBV 聚合酶與 ANP32 蛋白(bái)進行動力學/親和力表征。
研究人員(yuán)使用 CM5 芯片氨基偶聯 Anti-His 抗體(tǐ)自制 Anti-His 捕獲芯片,随後流經含有 His-IBV 聚合酶的細胞裂解液,捕獲 His-IBV 聚合酶。然後将 ANP32 蛋白(bái)稀釋到一(yī)系列濃度作爲流動相,使用 Biacore T200 對聚合酶與 ANP32 蛋白(bái)進行動力學/親和力表征。
實驗結果表明:與 Co-IP 結果一(yī)緻,huANP32A,chANP32A 和 huANP32A + 33 在 0.15625-5μM 的濃度下(xià)均能與病毒聚合酶結合(圖 4A – 4C)。相反,huANP32A_165T 幾乎不與聚合酶結合(圖 4D)。在另一(yī)個僅将兩個聚合酶亞基(PA 和 PB1)固定在 CM5 芯片上的對照實驗中(zhōng),在 huANP32A 和病毒聚合酶亞基之間未檢測到特異性親和力(圖 4E)。
通過 Biacore 分(fēn)析計算得出 huANP32A,chANP32A 和 huANP32A+ 33 的解離(lí)平衡常數(KD)有着顯著差異。huANP32A 與 IBV 聚合酶結合,KD = 0.05418μM,幾乎比 chANP32A 低 3 倍。插入 33 個氨基酸的 huANP32A 和聚合酶結合的 KD 值也從 0.05418μM 增加到 0.1013μM(圖 4F)。盡管 huANP32A,chANP32A 和 huANP32A + 33 具有相似的解離(lí)速率常數(kd),但結合速率常數(ka)卻截然不同。huANP32A 與 His-IBV 聚合酶結合的 ka 值是其他兩種蛋白(bái)質的 ka 值的兩倍。
該結果表明,與 ChANP32A 相比,huANP32A 對 IBV 聚合酶具有更強的結合親和力,并且 33 個氨基酸的插入降低了 ANP32A 與 IBV 聚合酶的結合親和力。
圖 4 IVB 聚合酶與 ANP32 蛋白(bái)互作 Biacore 結果
該研究揭示了哺乳動物(wù) ANP32 家族蛋白(bái)是支持 IBV 複制的關鍵宿主蛋白(bái),并明确了禽類 ANP32 蛋白(bái)無法支持病毒聚合酶活性的分(fēn)子機制(圖 5)。對理解 IBV 聚合酶功能、作用機理和宿主範圍決定因素具有重要意義,同時可爲抗 IBV 藥物(wù)靶點設計和跨物(wù)種傳播的防控提供理論依據。
圖 5 IAV 和 IBV 聚合酶對 ANP32 蛋白(bái)的選擇性使用及其分(fēn)子基礎
縱觀全文,Biacore 的技術優勢清晰易見
1、Biacore 區分(fēn)出不同物(wù)種、不同氨基酸結構的同源蛋白(bái)與 IBV 聚合酶相互作用的細微差異,這是 Co-IP 等同類技術所不具備的,充分(fēn)體(tǐ)現出 Biacore的分(fēn)辨率。
2、Biacore 互作信息,幫助研究人員(yuán)從 KD、ka、kd 等方向表征分(fēn)子相互作用,定量地闡釋不同分(fēn)子之間相互作用的異同點,從而幫助科研人員(yuán)好的闡明相關的分(fēn)子機制。
3、利用 Biacore 可以直接捕獲粗樣品中(zhōng)的目的蛋白(bái),并進行親和力動力學的表征。這這篇文章中(zhōng),研究人員(yuán)利用 Anti-His 捕獲芯片,能夠從細胞裂解液中(zhōng)直接捕獲 His-IBV 聚合酶,并檢測其與 ANP32 蛋白(bái)的互作。這樣隻需要純化一(yī)種蛋白(bái)即可進行的親和力動力學表征,降低了樣品準備時間與難度。
自 1990 年上市自今,Biacore 經過 30 年的發展,已經成爲分(fēn)子互作檢測的「金标準」,廣泛應用到基礎科研與藥物(wù)開(kāi)發的多個領域,累計發表的文章已經過四萬篇,過 80% 的上市抗體(tǐ)藥物(wù)在研發、申報與生(shēng)産中(zhōng)都使用了 Biacore。