新(xīn)聞中(zhōng)心

    流感多(duō)發季看TA怎麽保護你—— Biacore助力B型流感病毒感染種間限制機制新(xīn)發現

    近日,中(zhōng)國(guó)農業科(kē)學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所王曉鈞團隊在《PLoS Pathogens》雜志(zhì)刊載了題為(wèi) 「Selective usage of ANP32 proteins by influenza B virus polymerase: Implications in determination of host range」的文(wén)章。該文(wén)章系統性地揭示了 B 型流感病毒感染的種間限制機制,發現宿主 ANP32A&B 蛋白是決定 B 型流感病毒聚合酶活性的須關鍵因子。

     

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    甲型流感病毒(IAV)和乙型流感病毒(IBV)屬于正粘病毒科(kē)。禽類作(zuò)為(wèi) IAV 的重要宿主,經常将 IAV 跨物(wù)種傳播給哺乳動物(wù)。而 IBV 與 IAV 複制機制類似且受體(tǐ)相同,卻少有(yǒu)禽類自然感染 IBV 的報道,這說明 IBV 在禽類體(tǐ)内無法複制,但具(jù)體(tǐ)機制尚不明确。

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    圖 2   乙型流感病毒結構示意圖

    前期研究已經證明,宿主 ANP32A&B 蛋白在  IAV 聚合酶活性中(zhōng)起到關鍵性作(zuò)用(yòng),那麽 ANP32 蛋白是否在 IBV 的複制中(zhōng)也具(jù)有(yǒu)類似的功能(néng)呢(ne)?不同物(wù)種的 ANP32 蛋白是否為(wèi) IBV 提供不同的支持?

    研究團隊構建出不同的細胞系,利用(yòng)聚合酶雙熒光報告系統等技(jì )術,獲得重大發現,其中(zhōng)兩點尤為(wèi)突出:

    1.ANP32A、ANP32B 對于 IBV 的複制起主要作(zuò)用(yòng),ANP32E 的作(zuò)用(yòng)相對有(yǒu)限;

    2.哺乳動物(wù) ANP32A&B 蛋白可(kě)以完全支持 IBV 聚合酶複制,而禽類 ANP32A 由于有(yǒu) 33 個氨基酸的插入以及禽類 ANP32B 由于 129/130 位點的突變,導緻禽類 ANP32A&B 均無法支持 IBV 的複制。

    為(wèi)進一步探索不同物(wù)種 ANP32 蛋白支持 IBV 聚合酶活性差異的分(fēn)子機制,該研究利用(yòng) Co-IP,以及基于 Biacore 的表面等離子共振 SPR 等技(jì )術進行相關檢測。

    Co-IP 實驗結果顯示: huANP32A 和  chANP32A 對于 IBV 聚合酶具(jù)有(yǒu)相似的結合能(néng)力,但無法給出定量的結合差異分(fēn)析。為(wèi)了解決這個問題,研究人員使用(yòng) Biacore  對 IBV 聚合酶與 ANP32 蛋白進行動力學(xué)/親和力表征。

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    研究人員使用(yòng) CM5 芯片氨基偶聯 Anti-His 抗體(tǐ)自制 Anti-His 捕獲芯片,随後流經含有(yǒu) His-IBV 聚合酶的細胞裂解液,捕獲 His-IBV 聚合酶。然後将 ANP32 蛋白稀釋到一系列濃度作(zuò)為(wèi)流動相,使用(yòng) Biacore T200 對聚合酶與 ANP32 蛋白進行動力學(xué)/親和力表征。

    實驗結果表明:與 Co-IP 結果一緻,huANP32A,chANP32A 和 huANP32A + 33 在 0.15625-5μM 的濃度下均能(néng)與病毒聚合酶結合(圖 4A – 4C)。相反,huANP32A_165T 幾乎不與聚合酶結合(圖 4D)。在另一個僅将兩個聚合酶亞基(PA 和 PB1)固定在 CM5 芯片上的對照實驗中(zhōng),在 huANP32A 和病毒聚合酶亞基之間未檢測到特異性親和力(圖 4E)。

    通過 Biacore 分(fēn)析計算得出 huANP32A,chANP32A 和 huANP32A+ 33 的解離平衡常數(KD)有(yǒu)着顯著差異。huANP32A 與 IBV 聚合酶結合,KD = 0.05418μM,幾乎比 chANP32A 低 3 倍。插入 33 個氨基酸的 huANP32A 和聚合酶結合的 KD 值也從 0.05418μM 增加到 0.1013μM(圖 4F)。盡管 huANP32A,chANP32A 和 huANP32A + 33 具(jù)有(yǒu)相似的解離速率常數(kd),但結合速率常數(ka)卻截然不同。huANP32A 與 His-IBV 聚合酶結合的 ka 值是其他(tā)兩種蛋白質(zhì)的 ka 值的兩倍。

    該結果表明,與 ChANP32A 相比,huANP32A 對 IBV 聚合酶具(jù)有(yǒu)更強的結合親和力,并且 33 個氨基酸的插入降低了 ANP32A 與 IBV 聚合酶的結合親和力。

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    圖 4 IVB 聚合酶與 ANP32 蛋白互作(zuò) Biacore 結果


    該研究揭示了哺乳動物(wù) ANP32 家族蛋白是支持 IBV 複制的關鍵宿主蛋白,并明确了禽類 ANP32 蛋白無法支持病毒聚合酶活性的分(fēn)子機制(圖 5)。對理(lǐ)解 IBV 聚合酶功能(néng)、作(zuò)用(yòng)機理(lǐ)和宿主範圍決定因素具(jù)有(yǒu)重要意義,同時可(kě)為(wèi)抗 IBV 藥物(wù)靶點設計和跨物(wù)種傳播的防控提供理(lǐ)論依據。

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    圖 5 IAV 和 IBV 聚合酶對 ANP32 蛋白的選擇性使用(yòng)及其分(fēn)子基礎

    縱觀全文(wén),Biacore 的技(jì )術優勢清晰易見

    1、Biacore 區(qū)分(fēn)出不同物(wù)種、不同氨基酸結構的同源蛋白與 IBV 聚合酶相互作(zuò)用(yòng)的細微差異,這是 Co-IP 等同類技(jì )術所不具(jù)備的,充分(fēn)體(tǐ)現出 Biacore的分(fēn)辨率。

    2、Biacore 互作(zuò)信息,幫助研究人員從 KD、ka、kd 等方向表征分(fēn)子相互作(zuò)用(yòng),定量地闡釋不同分(fēn)子之間相互作(zuò)用(yòng)的異同點,從而幫助科(kē)研人員好的闡明相關的分(fēn)子機制。

    3、利用(yòng) Biacore 可(kě)以直接捕獲粗樣品中(zhōng)的目的蛋白,并進行親和力動力學(xué)的表征。這這篇文(wén)章中(zhōng),研究人員利用(yòng) Anti-His 捕獲芯片,能(néng)夠從細胞裂解液中(zhōng)直接捕獲 His-IBV 聚合酶,并檢測其與 ANP32 蛋白的互作(zuò)。這樣隻需要純化一種蛋白即可(kě)進行的親和力動力學(xué)表征,降低了樣品準備時間與難度。

    自 1990 年上市自今,Biacore 經過 30 年的發展,已經成為(wèi)分(fēn)子互作(zuò)檢測的「金标準」,廣泛應用(yòng)到基礎科(kē)研與藥物(wù)開發的多(duō)個領域,累計發表的文(wén)章已經過四萬篇,過 80% 的上市抗體(tǐ)藥物(wù)在研發、申報與生産(chǎn)中(zhōng)都使用(yòng)了 Biacore。

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