當前，以PacBio、Nanopore為(wèi)代表的三代測序技(jì )術已成為(wèi)全基因組測序（WGS）的主流方法。利用(yòng)無需PCR過程的單分(fēn)子測序技(jì )術，進行長(cháng)讀長(cháng)測序，無論是對基因組組裝(zhuāng)還是基因組變異檢測，都具(jù)有(yǒu)很(hěn)高的準确率。更可(kě)利用(yòng)測序過程中(zhōng)聚合酶反應的動力學(xué)變化，分(fēn)析基因組學(xué)和表觀遺傳學(xué)數據，适合于基于多(duō)組學(xué)研究的應用(yòng)場景。

結合當前大力發展中(zhōng)醫(yī)藥研究及産(chǎn)業化的時代大背景，基于全基因組測序及多(duō)組學(xué)研究的技(jì )術，已經成為(wèi)了中(zhōng)醫(yī)藥科(kē)學(xué)研究的重要推動力。日前，來自醫(yī)科(kē)大學(xué)、中(zhōng)醫(yī)科(kē)學(xué)院道地藥材重點實驗室、以及安(ān)諾優達的聯合團隊利用(yòng)PacBio三代測序技(jì )術，發表了一個染色體(tǐ)水平的高質(zhì)量三七參考基因組，并通過基因組演化分(fēn)析，鑒定了系統發育與全基因組複制事件對于皂苷合成的影響。

三七是五加科(kē)人參屬的多(duō)年生草(cǎo)本植物(wù)，因其廣泛的藥理(lǐ)學(xué)作(zuò)用(yòng)，在中(zhōng)國(guó)近千年的臨床治療中(zhōng)發揮了重要的作(zuò)用(yòng)。結合多(duō)組學(xué)研究數據，研究人員還對三七進行了詳細的轉錄水平分(fēn)析，揭示了三七的小(xiǎo)塊莖形成的基因調控機制，從時間和空間水平上，進一步研究了皂苷的合成和調控。鑒定到了5個糖基轉移酶基因，在三七中(zhōng)催化不同的人參皂苷的形成。

文(wén)章中(zhōng)所報道的三七全基因組數據為(wèi)将來進一步研究三七生長(cháng)特性、栽培、育種以及皂苷合成提供了遺傳數據資源。這一成果發表于核心期刊《Plant Communications》。

三代全基因組測序對基因組DNA的濃度、純度有(yǒu)較高要求，隻有(yǒu)質(zhì)量合格的樣品才能(néng)進入測序流程，否則将導緻錯誤的産(chǎn)生。   

本文(wén)中(zhōng)樣品質(zhì)控使用(yòng)了Implen的Nanophotometer®及Qubit 2.0，分(fēn)别對提取的基因組DNA進行純度及濃度檢測。A260/A280、A260/A230方法為(wèi)核酸樣品質(zhì)控的通用(yòng)方法，同時也是目前的标準方法。Nanophotometer®可(kě)以準确的測量A260/A280和A260/A230，提供完整的DNA純度數據，完全符合期刊對于數據完整性的要求。

這得益于設備高精(jīng)度的光學(xué)結構，在全波長(cháng)掃描下可(kě)同時獲得全波長(cháng)數據。無論是NGS，三代測序，還是QPCR，DNA還是RNA，Nanophotometer®都可(kě)以令您得心應手，助力您的科(kē)學(xué)研究。

如果您使用(yòng)基因測序作(zuò)為(wèi)研究手段，可(kě)根據通量需求選擇Implen的N60或N120系列，實現對少量或大量核酸樣本的質(zhì)控。N60作(zuò)為(wèi)單通道設備，性能(néng)出衆，操作(zuò)便捷；N120可(kě)一次測量12個樣品，得到準确結果。二者均具(jù)有(yǒu)很(hěn)好的波長(cháng)精(jīng)度，适合多(duō)波長(cháng)測量下的比值數據獲取。

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